La revisión conceptual de los límites del análisis en la teoría freudiana nos condujo a nuevas vías de investigación relativas a los efectos y consecuencias que se derivan de la formalización de la segunda tópica. La formulación de la segunda tópica constituye un nuevo desarrollo metapsicológico que no sustituye a la primera tópica, sino que está destinado a abordar los fenómenos clínicos que no responden a la lógica a partir de la cual se construye la primera. Al diferenciar un tercer sentido del término inconciente, Freud puede tematizar el ello, el yo y el superyó como instancias del aparato y producir una redefinición de la estructura anímica. Estas nuevas teorizaciones permiten recuperar e inscribir fenómenos clínicos tales como la angustia, lo traumático, la melancolía, la compulsión de repetición, la reacción terapéutica negativa, las neurosis graves, el sentimiento inconciente de culpa, y al mismo tiempo, recortar y abordar nuevos fenómenos tales como el suicido y los rasgos de carácter, entre otros. Dichos fenómenos clínicos testimonian de los obstáculos que Freud posteriormente ubicará como estructurales al articularlos con las resistencias mayores en la cura.